二氧化碳培養箱用途廣泛，主要用來培養細胞、組織和某些特殊微生物，為它們提供一個良好的體外培養環境，廣泛應用于細胞學實驗、微生物學實驗、組織學實驗以及分子生物學實驗。因此，它的清潔維護尤為重要。
二氧化碳培養箱的常見污染：
進入二氧化碳培養箱培養環境中，對細胞生存有害的成分和造成細胞不純的異物都應視為污染。不同的污染物對細胞的影響也有差別，有的影響是長期、緩慢和潛在的，而有的則能在很短的時間內抑制細胞生長或殺死細胞。根據污染源不同主要可以分為：生物性污染、化學性污染、物理性污染和氣溶膠污染。
1、生物性污染：
這是常見也是危害較大的污染。如細菌、病毒、真菌，支原體等。這些污染源有可能是人為帶入，或是細胞在放入二氧化碳培養箱前已經受污染，再或者是箱體本身沒有消毒干凈。體外培養的細胞自身沒有抵抗污染的能力，而培養基中所加抗生素的抗微生物污染的能力也是有限的，因而細胞微生物污染一旦發生往往是無法挽救的。
2、化學性污染：
設備中許多化學物質都可以引起細胞污染。如細胞培養容器清洗過程中殘留的洗滌劑、加濕器中未純化的水、人為帶入的液體或氣體都可能成為化學性污染的來源。不同化學物質對細胞污染是不一樣的，有的可能促進或抑制細胞生長，有的甚至殺死細胞。
3、物理性污染：
培養環境中的物理因素，如溫度、放射線、振動、輻射（紫外線或熒光）會對細胞產生影響。物理性污染常常被人們所忽視，其主要是在代謝水平或分子水平上，影響細胞正常的生理過程。
4、氣溶膠污染：
氣溶膠是液體或固體微粒均勻地懸浮在氣體介質中的分散體系，當微粒是微生物時，就是微生物氣溶膠，如果這種微生物是病原性的，就是病原微生物氣溶膠。細菌、病毒等病原體通過氣溶膠可在人與人、人與環境之間傳播。
二氧化碳培養箱污染防控措施：
1、選擇：
制造商們設計了多種不同的裝置去減少和防止污染的發生，其主要是防污染設計和消毒滅菌系統的改進，以達到消毒滅菌的目的。如帶有紫外消毒功能的、帶HEPA過濾器凈化空氣的，以及帶高溫滅菌的二氧化碳培養箱等，后者又分為高溫干熱和高溫濕熱兩類。這些裝置的滅菌能力各有千秋，紫外燈消毒范圍有限，距離燈越遠，或者被遮擋，消毒能力越差。
HEPA過濾器的過濾膜孔徑有限，無法去除病毒和一些微小細菌，并且容易損耗，也有其局限性。相比而言，高溫滅菌則是比較有效的方法。而高溫干熱和高溫濕熱也有所不同，不同方法的滅菌效率與溫度的高低也有著直接的關系。上海潤度生物推出的Herocell系列二氧化碳培養設備可進行140℃的高溫干熱滅菌，當然也可進行90℃的濕熱滅菌，為用戶的滅菌方式提供了豐富的可選擇性。
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